Iga Hakuun Ryu Ninpo wurde während der Jinpyo Heiji-Ära (1151-1160) von Hakuun Doshi gegründet. Er unterrichtete Kimon Heibei und Tozawa Hakuunsai (Tozawa Kaneuji, der Vasall von Minamoto Tameto war). Heibei und Hakuunsai wurden von Hachiryu Nyudo unterrichtet, einem Experten für Kosshijutsu. Hachiryu Nyudo wurde von Garyu Doshi unterrichtet. Garyu Doshi erhielt diese Techniken von Gamon Doshi, der von einem verbannten Ikai Shogun aus China unterrichtet wurde und in den Iga-Bergen lebte. Tozawa Hakuunsai war einer der Pioniere des Hakuun Ryu Ninpo mit dem Schwerpunkt auf Genjutsu (illusionäre Techniken). Es ist besonders für die Dämonen-Waza bekannt: Inki, Doki, Fuki und Kaki. Dieses Ninjutsu steht für „mystische Wege“.
Hakuun Ryu Ninpo ist der Ursprung des Togakure Ryu Ninpo. Die Techniken der Gyokko Ryu, Koto Ryu, Gikan Ryu, Kumogakure Ryu und Kasumi Ryu stützen sich stark auf die des Hakuun Ryu Ninpo. Auf Anordnung von Hakuunsai und Hakuun Doshi wurde die Verwendung des Ryu-Namens gestoppt.
In der Ohbo-Ära (1161-1163) stammte er von Hakuun Doshi ab, der Kain Doshi unterrichtete, der wiederum Togakure Daisuke unterwies. Daisuke lehrte Shima Kosanta Minamoto No Kanesada, der später den Namen seines Lehrers übernahm und so zum 2. Generationsoberhaupt namens Togakure Daisuke wurde. Kanesada (16 Jahre alt) war Vasall von Shogun Yoshinaka während einer Schlacht im Juli 1161. Er kämpfte tapfer, wurde jedoch schwer verletzt und verlor das Bewusstsein. Als er später wieder zu sich kam, begab er sich in die Iga-Berge, wo er von Kain Doshi und dem 1. Togakure Daisuke gerettet und im Ninjutsu unterrichtet wurde.
Die zweite Generation von Togakure Daisuke (Kanesada) wurde als Togakure Ryu Ninja berühmt. Nach der Schlacht zwischen den Nord- und Südemperatoren suchten viele der besiegten Soldaten Zuflucht in denselben Bergen, und ihr Einfluss auf die Regionen Iga und Koga revolutionierte das Ninjutsu.
Gemäß den Legenden des Ninjutsu und Ninpo: Im Jahr 986 verlor der brillante chinesische General Ikai einen Krieg und entschied sich ins Exil nach Japan zu gehen. Er flüchtete und lebte in einer Höhle in den Iga-Bergen. Er war ein Experte in Hichojutsu und Ongyojutsu. Es ist dokumentiert, dass er mithilfe eines besonderen Kiai-Schreis eine Höhe von 6 Metern springen konnte.
Meiner ehrlichen Meinung nach ist Ninjutsu eng mit der Amatsu-Tatara-Linie verbunden. Dies ist eine wahre Tatsache. Zum Beispiel kenne ich vier Arten alter Schriftrollen, die von den Clans Ohtomo, Mononobe, Abe und Nakatomi gehalten werden. Diese Schriftrollen tragen die Titel: Ohtomo Amatsu Tatara Kishin no Hibun, Mononobe Amatsu Tatara Hisshin Mokuroku, Abe (Ohhikonaga) Amatsu Tatara Rinpo Hiden No Maki und Kuki Amatsu Tatara Nakatomi Hibun. Gamon Doshi verwendete immer den Ausdruck: „Für den Kampfkünstler ist ein Herz der spirituellen Harmonie am wichtigsten! Ich weigere mich, jemandem beizubringen, der keine Harmonie und Frieden in seiner Seele hat.“
Der erste Satz in der Togakure-Schriftrolle lautet: „Töte niemanden, entweder entkomme oder verschwinde und lerne ‚Herz der Blume und Geist des Bambus‘, ‚Gottes Herz und Gottes Augen‘, ‚Vereinigung von Geist, Seele, Körper‘ und die Tugenden des Ninpo.“ Hakuunsai sagte: „Banpen Fugyo“ (Sei unerschütterlich, egal was passiert). Im Hakuun Ryu Ninpo liegt der Schwerpunkt des Trainings auf der Kontrolle des Geistes und der Seele. Dabei wird eine spezielle Kuji Kiri verwendet. Wie der fließende Fluss ist das Herz des Hakuun Ryu, und der Schwerpunkt des Kumogakure Ryu liegt darin, „wie ein Schatten hinter dem Mond zu sein, der nach den Wolken erscheint“. Gyokko Ryu hat den Schwerpunkt auf Tenmon Chimon und Shin Shin Shingan.